基因表达
GTEx_Analysis_2017-06-05_v8_RNASeQCv1.1.9_gene_reads.gct
56,200 entries, 17384 total columns
| Name | Description | GTEX-1117F-0226-SM-5GZZ7 | GTEX-1117F-0426-SM-5EGHI | GTEX-1117F-0526-SM-5EGHJ |
|---|---|---|---|---|
| ENSG00000223972.5 | DDX11L1 | 0 | 0 | 0 |
| ENSG00000227232.5 | WASH7P | 187 | 109 | 143 |
| ENSG00000278267.1 | MIR6859-1 | 0 | 0 | 1 |
文件中的这些 ID（如 GTEX-1117F-0226-SM-5GZZ7、GTEX-1117F-0426-SM-5EGHI、GTEX-1117F-0526-SM-5EGHJ）是 GTEx 数据库中特定样本的唯一标识符，这些 ID 代表了不同个体的特定组织样本。这些样本用于 RNA-Seq 分析，以研究基因在不同组织中的表达情况。每个 ID 的含义如下：
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GTEX-1117F-0226-SM-5GZZ7：代表供体 GTEX-1117F 的皮下脂肪组织（Adipose - Subcutaneous）样本。
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GTEX-1117F-0426-SM-5EGHI：代表供体 GTEX-1117F 的骨骼肌（Muscle - Skeletal）样本。
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GTEX-1117F-0526-SM-5EGHJ：代表供体 GTEX-1117F 的胫动脉（Artery - Tibial）样本。
补充数据2
| ID | Chromosome | Position | REF | ALT | rhyGene.ID | rhyGene.name | Sample.size.0 | Sample.size.1 | Sample.size.2 | pval_0 | phase_0 | amp_0 | pval_1 | phase_1 | amp_1 | Chosen.model | G.test_pval | pval |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| chr1_27360875_C_G_b38 | chr1 | 27360875 | C | G | ENSG00000000938.12 | FGR | 261 | 249 | 59 | 0.0001808324195 | 19.7955 | 0.6269 | 0.363501568701486 | 20.4849 | 0.18745 | 2 | 0 | 0.0001882465807 |
| chr1_28566248_G_A_b38 | chr1 | 28566248 | G | A | ENSG00000000938.12 | FGR | 257 | 239 | 73 | 0.475559478668355 | 20.0835 | 0.1803 | 4.40078612105749e-6 | 19.2889 | 0.7245 | 3 | 0 | 9.32080383273013e-7 |